Export local studies using UPS Template

Обзор

Эта страница кратко описывает альтернативу существующей реализации: - Export Studies specified in CSV - Mark studies for Export - Export matching studies

Конфигурация

В архиве преднастроено UPS Processing Rule для экспорта DICOM-экземпляров в STORESCP.
Создайте UPS Template Workitem со следующими изменениями в JSON полезных данных запроса.
Чтобы записи UPS, созданные UPS template workitem, обрабатывались преднастроенным правилом UPS processing, установите значение Scheduled Workitem Code Sequence (0040,4018) так, чтобы оно совпадало со значением правила UPS processing.
Чтобы изменить назначение по умолчанию (STORESCP), настройте Remote Application Entity и использайте это значение в Destination AE последовательности DICOM Storage Sequence из Output Destination Sequence.

Варианты использования

Поскольку создание записей UPS с использованием функции UPS template пока не реализовано в UI:
Create UPS records for local studies specified in CSV file
Create UPS records for local matching studies это можно протестировать непосредственно через RESTful-сервис с помощью curl.
Запустите storescp, который выступает в качестве назначения.
См. UPS Template Workitem для создания / поиска UPS Template Workitems.

Создание записей UPS для локальных исследований с использованием CSV-файла

Создайте / получите CSV-файл, содержащий Study Instance UID и (желательно также) Patient ID с issuer в формате HL7CX, связанные с этими исследованиями в локальном архиве. Обратите внимание, что если в CSV-файле нет Patient ID, то записи UPS для разных исследований будут созданы для одного фиктивного пациента. Укажите номера полей, содержащих study instance UID и Patient ID с issuer в формате HL7CX.
Выберите SOP Instance UID (0008,0018) желаемого UPS Template Workitem из ответа search UPS template workitem и использайте это значение как upsTemplateUID в следующем сервисе.

curl -v -H "Content-type: text/csv" -X POST 'http[s]://<archive-host>:<port>/dcm4chee-arc/aets/<LocalArchiveAET>/rs/studies/csv:1/workitems/<upsTemplateUID>?csvPatientID=2' --data-binary @testExportCSV.csv Опционально в приведённом выше запросе можно передать следующие фильтры, значения которых будут установлены в создаваемых UPS workitems - upsLabel: Procedure Step Label (можно использовать аналогично существующему Batch ID в задачах экспорта) - upsScheduledTime: Scheduled Procedure Step Start DateTime

Создание записей UPS для локальных соответствующих исследований

Протестируйте Create UPS records for local matching studies. - Выберите желаемые атрибуты UPS Template Workitem из ответа и создайте JSON-файл с этим набором данных. Этот JSON-файл будет отправлен как полезные данные запроса в вызываемом сервисе. curl -v -H "Content-type:application/dicom+json" -X POST 'http[s]://<archive-host>:<port>/dcm4chee-arc/aets/<LocalArchiveAET>/rs/studies/workitems' --data @upsTemplateWorkitemAttrs.json Опционально в приведённом выше запросе можно передать следующие фильтры, значения которых будут установлены в создаваемых UPS workitems - upsLabel: Procedure Step Label (можно использовать аналогично существующему Batch ID в задачах экспорта) - upsScheduledTime: Scheduled Procedure Step Start DateTime

Проверка

Проверьте, что записи UPS были созданы, выполнив их поиск в Navigation -> UWL и указав требуемые фильтры.
По достижении Scheduled Procedure Step Start DateTime созданные записи UPS обрабатываются, и объекты принимаются на стороне назначения.
Проверьте список SOP-экземпляров, подлежащих экспорту, в Input Information Sequence.
Проверьте список SOP-экземпляров, экспортированных в назначение, в Output Information Sequence. Кроме того, эта последовательность содержит DICOM Retrieval Sequence, в котором есть Retrieve AE Title, указывающий на назначение, куда были отправлены объекты.

Запросы/ответы C-STORE можно также проверить в журнале сервера Wildfly:

10:28:38,442 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301102, uid=2.25.100473029688271913202159087210857419651, state=IN PROGRESS]
10:28:38,502 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Initiate connection from /0.0.0.0:0 to localhost:11115
10:28:38,503 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Established connection Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=54289]
10:28:38,503 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(78) << A-ASSOCIATE-RQ
10:28:38,559 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(78) >> A-ASSOCIATE-AC
10:28:38,561 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(78) << 1:C-STORE-RQ[pcid=1, prior=0
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2402.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,610 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(78) >> 1:C-STORE-RSP[pcid=1, status=0H
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2402.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,610 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(78) << A-RELEASE-RQ
10:28:38,610 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(78) >> A-RELEASE-RP
10:28:38,610 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(78): close Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=54289]
10:28:38,614 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301102, uid=2.25.100473029688271913202159087210857419651, state=COMPLETED]
10:28:38,622 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301103, uid=2.25.6276948729160947272766048718277463363, state=IN PROGRESS]
10:28:38,629 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Initiate connection from /0.0.0.0:0 to localhost:11115
10:28:38,629 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Established connection Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=47807]
10:28:38,629 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(79) << A-ASSOCIATE-RQ
10:28:38,631 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(79) >> A-ASSOCIATE-AC
10:28:38,632 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(79) << 1:C-STORE-RQ[pcid=1, prior=0
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2422.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,633 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(79) >> 1:C-STORE-RSP[pcid=1, status=0H
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2422.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,633 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(79) << A-RELEASE-RQ
10:28:38,636 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(79) >> A-RELEASE-RP
10:28:38,637 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(79): close Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=47807]
10:28:38,638 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301103, uid=2.25.6276948729160947272766048718277463363, state=COMPLETED]
10:28:38,645 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301104, uid=2.25.186335400358589000509692265547965406889, state=IN PROGRESS]
10:28:38,652 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Initiate connection from /0.0.0.0:0 to localhost:11115
10:28:38,653 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Established connection Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=33669]
10:28:38,653 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(80) << A-ASSOCIATE-RQ
10:28:38,654 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(80) >> A-ASSOCIATE-AC
10:28:38,655 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(80) << 1:C-STORE-RQ[pcid=1, prior=0
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2405.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,656 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(80) >> 1:C-STORE-RSP[pcid=1, status=0H
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2405.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,657 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(80) << A-RELEASE-RQ
10:28:38,657 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(80) >> A-RELEASE-RP
10:28:38,657 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(80): close Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=33669]
10:28:38,661 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301104, uid=2.25.186335400358589000509692265547965406889, state=COMPLETED]
10:28:38,672 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301100, uid=2.25.309382704025312744568597778106777211805, state=IN PROGRESS]
10:28:38,681 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Initiate connection from /0.0.0.0:0 to localhost:11115
10:28:38,682 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Established connection Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=48309]
10:28:38,682 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(81) << A-ASSOCIATE-RQ
10:28:38,684 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(81) >> A-ASSOCIATE-AC
10:28:38,685 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(81) << 1:C-STORE-RQ[pcid=1, prior=0
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2423.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,686 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(81) >> 1:C-STORE-RSP[pcid=1, status=0H
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2423.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,694 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(81) << A-RELEASE-RQ
10:28:38,695 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(81) >> A-RELEASE-RP
10:28:38,695 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(81): close Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=48309]
10:28:38,699 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301100, uid=2.25.309382704025312744568597778106777211805, state=COMPLETED]
10:28:38,706 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301101, uid=2.25.328539383328043845939389893915725237171, state=IN PROGRESS]
10:28:38,714 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Initiate connection from /0.0.0.0:0 to localhost:11115
10:28:38,714 INFO  [org.dcm4che3.net.Connection] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) Established connection Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=52291]
10:28:38,714 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(82) << A-ASSOCIATE-RQ
10:28:38,716 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(82) >> A-ASSOCIATE-AC
10:28:38,717 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(82) << 1:C-STORE-RQ[pcid=1, prior=0
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2424.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,719 INFO  [org.dcm4che3.net.Dimse] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(82) >> 1:C-STORE-RSP[pcid=1, status=0H
  cuid=1.2.840.10008.5.1.4.1.1.20 - Nuclear Medicine Image Storage
  iuid=1.2.840.113654.2.3.2004.1.2424.1.101 - ?
  tsuid=1.2.840.10008.1.2 - Implicit VR Little Endian]
10:28:38,722 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE->STORESCP(82) << A-RELEASE-RQ
10:28:38,724 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(82) >> A-RELEASE-RP
10:28:38,724 INFO  [org.dcm4che3.net.Association] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-777) DCM4CHEE->STORESCP(82): close Socket[addr=localhost/127.0.0.1,port=11115,localport=52291]
10:28:38,728 INFO  [org.dcm4chee.arc.ups.impl.UPSServiceEJB] (EE-ManagedExecutorService-default-Thread-773) DCM4CHEE: Update UPS[pk=301101, uid=2.25.328539383328043845939389893915725237171, state=COMPLETED]